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數(shù)據(jù)庫遷移

2020-11-05 10:49:28

數(shù)據(jù)庫遷移即將某數(shù)據(jù)源庫中的數(shù)據(jù)移動到另一數(shù)據(jù)庫之間的操作。主要分為熱遷移和冷遷移。熱遷移是將內(nèi)存數(shù)據(jù)和硬盤數(shù)據(jù)同步進(jìn)行遷移。它對用戶業(yè)務(wù)的影響非常小。熱遷移過程是對數(shù)據(jù)庫中的內(nèi)存數(shù)據(jù)進(jìn)行遷移，用戶業(yè)務(wù)應(yīng)用對其是無感知的。而缺點(diǎn)是熱遷移的過程不可中斷，整個(gè)操作過程相對復(fù)雜。冷遷移即關(guān)機(jī)遷移。操作簡單，一般為自動化操作。其缺點(diǎn)是不支持內(nèi)存數(shù)據(jù)的保存，容易導(dǎo)致內(nèi)存數(shù)據(jù)的丟失。

數(shù)據(jù)庫審計(jì)

2020-11-05 10:45:26

數(shù)據(jù)庫 審計(jì)（簡稱DBAudit）能夠?qū)崟r(shí)記錄網(wǎng)絡(luò)上的數(shù)據(jù)庫活動，它是一種對數(shù)據(jù)庫操作進(jìn)行細(xì)粒度審計(jì)的合規(guī)性管理，它可以對數(shù)據(jù)庫遭受到的風(fēng)險(xiǎn)行為進(jìn)行告警，對攻擊行為進(jìn)行阻斷。

racon是什么

2020-11-05 10:39:27

racon是一款在Github上發(fā)布的C++開源軟件，用于對一些不產(chǎn)生consensus的快速組裝軟件組裝得到的原始contig序列的糾錯(cuò)，生成基因組一致性序列，同時(shí)支持Pacbio和Oxford Nanopore測序數(shù)據(jù)。

MySQL

2020-11-05 10:38:56

MySQL是一種關(guān)系型數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)，它將數(shù)據(jù)保存在不同的表中，而不是放在一個(gè)大倉庫內(nèi)，增加了訪問速度并提高了靈活性。MySQL所使用的 SQL 語言是用于訪問數(shù)據(jù)庫的最常用標(biāo)準(zhǔn)化語言。MySQL軟件分為社區(qū)版和商業(yè)版，由于其體積小、速度快、成本低、開放源碼等特點(diǎn)，受到廣大中小型網(wǎng)站開發(fā)者的喜愛。MySQL 是目前最流行的開源型關(guān)系數(shù)據(jù)庫，大多應(yīng)用于互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)。例如：網(wǎng)站系統(tǒng)、日志記錄系統(tǒng)、 數(shù)據(jù)倉庫 系統(tǒng)等。

Minimap2是什么

2020-11-05 10:07:19

Minimap2是一種??多功能序列比對程序，可將DNA或mRNA序列與大型參考數(shù)據(jù)庫對齊。

什么是Miniasm

2020-11-05 10:01:08

Miniasm是由李恒開發(fā)，適合于小基因組及重復(fù)序列比例低的基因組組裝，相對于Canu和Falcon軟件，Miniasm組裝速度非?？?。

ROMs是什么

2020-11-05 09:55:45

ROMs（Regional Ocean Modeling System）是海洋研究機(jī)構(gòu)常用的區(qū)域和大洋環(huán)流模式，已經(jīng)在CO-OPS開始得到大量使用，并且將其列為業(yè)務(wù)化海洋模式之一。R OMS 模式采用F90/F95編寫，代碼結(jié)構(gòu)依據(jù)網(wǎng)格特點(diǎn)編寫，支持共享存儲和消息傳遞兩種多處理器體系架構(gòu)，其對集群性能要求較高，具有計(jì)算密集、IO讀寫量較大、網(wǎng)絡(luò)延遲帶寬要求高的特點(diǎn)。

什么是FVCOM

2020-11-05 09:40:36

FVCOM是無結(jié)構(gòu)三角形網(wǎng)格架構(gòu)、有限體積、自由表面、三維原始方程海洋數(shù)值模型，包含了多種物理、水質(zhì)、生態(tài)計(jì)算模塊。FVCOM模型輸入輸出基于標(biāo)準(zhǔn)化NETCDF格式，具有平臺通用兼容性，并能使用VISIT可視化軟件是輸入輸出結(jié)構(gòu)進(jìn)行快速二維/三維可視化。

CMAQ是什么

2020-11-05 09:31:54

CMAQ（Community Multiscale Air Quality通用多尺度空氣質(zhì)量）模型，是美國環(huán)保局開發(fā)的第三代空氣質(zhì)量預(yù)報(bào)和評估系統(tǒng)（Models-3）的核心組成之一

什么是SAMtools

2020-11-04 17:41:02

SAMtools是一組實(shí)用程序，用于與Heng Li編寫的SAM，BAM和C RAM 格式的短DNA序列讀取比對進(jìn)行交互并進(jìn)行后處理。這些文件是由短讀取對齊器（如BWA）作為輸出生成的。提供了簡單和高級工具，支持復(fù)雜任務(wù)，例如變體調(diào)用和對齊查看以及分類、索引、數(shù)據(jù)提取和格式轉(zhuǎn)換。

如何配置StringTie

2020-11-04 17:16:12

StringTie是一種快速高效的RNA-Seq序列比對組裝器。它的輸入不僅包括其他轉(zhuǎn)錄本匯編程序也可以使用短讀序列的對比。為了在實(shí)驗(yàn)之間鑒定差異表達(dá)的基因，可以使用Ballgown，Cuffdiff或其他（DESeq，edgeR等）專用軟件來處理StringTie的輸出。

HTSeq是什么

2020-11-04 17:13:59

HTSeq是使用Python編寫的一支用于進(jìn)行基因Count表達(dá)量分析的軟件，能根據(jù)SAM/BAM比對結(jié)果文件和基因結(jié)構(gòu)注釋GTF文件得到基因水平的Counts表達(dá)量。HTSeq進(jìn)行Counts計(jì)算的原理簡單易懂，容易上手。

gvcftools是什么

2020-11-04 16:53:03

gvcftools是用于創(chuàng)建和分析gVCF文件的小型實(shí)用程序包

什么是GATK?

2020-11-04 16:48:09

GATK全稱Genome Anlysis Toolkit，是一套用于分析基因組的工具箱。主要功能是尋找變異位點(diǎn)和基因分型，用于從sequencing數(shù)據(jù)中進(jìn)行variant calling，包括SNP、INDEL。

BreakDancer是什么

2020-11-04 16:34:11

BreakDancer是一個(gè)C++軟件包，可提供下一代配對末端測序讀取的全基因組結(jié)構(gòu)變異檢測。它包括兩個(gè)補(bǔ)充程序，BreakDancerMax預(yù)測五種類型的結(jié)構(gòu)變異；BreakDancerMini專注于使用正態(tài)映射的讀取對檢測小插入缺失。

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