簡介
miRanda是一種用于尋找microRNA基因組標靶的算法。該算法有C語言編寫，可視作GPL下的開源方法使用。
配置流程
1.配置編譯環(huán)境
安裝wget。
yum install wget-y
2.獲取源碼
獲取“miRanda-v3.3a”源碼包。
cd/usr/local/ wget http://cbio.mskcc.org/microrna_data/miRanda-aug2010.tar.gz
3.編譯和安裝
1）解壓并進入源碼包。
tar-zxvf miRanda-aug2010.tar.gz cd miRanda-3.3a
2）生成Makefile文件。
./configure--prefix=/usr/local/miranda--build=arm
3）編譯安裝miRanda。
make-j4&&make install
4）設置軟連接。
In-s/usr/local/miranda/bin/miranda/usr/bin/miranda
4.運行和驗證
查看miRanda版本信息。
miranda--version
當系統(tǒng)回顯類似如下信息時，表示miranda安裝成功執(zhí)行成功。
=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= miranda v3.3a micriRNA Target Scanning Algorithm =-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-= (c)2003 Memorial Sloan-Kettering Cancer Center,New York Authors:Anton Enright,Bino John,Chris Sander and Debora Marks (mirnatargets(at)cbio.mskcc.org-reaches-all authors)
