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基因,可以使用Ballgown,Cuffdiff或其他(DESeq,edgeR等)專用軟件來處理StringTie的輸出。 配置流程 1.配置編譯環(huán)境 安裝相關(guān)依賴 yum install-y zlib zlib-devel 2.獲取源碼 獲取“stringtie-1.3.6”源碼包。來自:百科對(duì)簡單的任務(wù)(例如,將兩個(gè)間隔文件相交),但可以通過在UNIX命令行上組合多個(gè)bedtools操作來進(jìn)行相當(dāng)復(fù)雜的分析。 配置流程 1. 配置編譯環(huán)境 安裝相關(guān)依賴。 yum install zlib-devel bzip2-devel xz-devel -y 2. 獲取源碼 獲取“bedtools-2來自:百科
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的格式。 編譯和測(cè)試方式 1.配置編譯環(huán)境 1)安裝wget工具。 yum install wget -y 2)安裝或者升級(jí)cmake版本到3.1.0或更高版本。 cd /usr/local/src yum remove cmake cmake-data wget https://cmake來自:百科
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