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基因,可以使用Ballgown,Cuffdiff或其他(DESeq,edgeR等)專用軟件來處理StringTie的輸出。 配置流程 1.配置編譯環(huán)境 安裝相關(guān)依賴 yum install-y zlib zlib-devel 2.獲取源碼 獲取“stringtie-1.3.6”源碼包。來自:百科中: a. cpg.bed:人類基因組中的CpG島。 b. exons.bed:人類基因的RefSeq外顯子。 c. gwas.bed:在全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)中鑒定的與人類疾病相關(guān)的SNP。 2)獲取交集信息。 比如,找到A和B文件中重疊的部分。 bedtools intersect來自:百科
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