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云知識(shí) SnpEff如何配置 SnpEff如何配置 時(shí)間:2020-11-03 14:31:58 簡(jiǎn)介 SnpEff是一款常用的突變位點(diǎn)注釋工具。這款軟件基于Java語(yǔ)言開(kāi)發(fā),安裝過(guò)程相對(duì)簡(jiǎn)單,下載后解壓縮即可使用。 配置流程 1.配置編譯環(huán)境 1)安裝JDK1.8。 yum install-y來(lái)自:百科3)編譯完成后,在當(dāng)前目錄下會(huì)生成“libtinyxml2.a”庫(kù)文件,此時(shí)即可用該庫(kù)文件編譯項(xiàng)目。 測(cè)試已完成編譯的軟件 1.測(cè)試該靜態(tài)庫(kù)是否可以正常使用。 在解壓目錄下有一個(gè)“xmltest.cpp”文件,是項(xiàng)目默認(rèn)的測(cè)試程序(也可自行編寫(xiě)程序),執(zhí)行命令使用鏈接靜態(tài)庫(kù)編譯該cpp文件。 g++ -o來(lái)自:百科
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補(bǔ)和混洗。雖然每個(gè)工具都設(shè)計(jì)為執(zhí)行相對(duì)簡(jiǎn)單的任務(wù)(例如,將兩個(gè)間隔文件相交),但可以通過(guò)在UNIX命令行上組合多個(gè)bedtools操作來(lái)進(jìn)行相當(dāng)復(fù)雜的分析。 配置流程 1. 配置編譯環(huán)境 安裝相關(guān)依賴。 yum install zlib-devel bzip2-devel xz-devel來(lái)自:百科華為云計(jì)算 云知識(shí) 如何配置StringTie 如何配置StringTie 時(shí)間:2020-11-04 17:16:12 簡(jiǎn)介 StringTie是一種快速高效的RNA-Seq序列比對(duì)組裝器。它的輸入不僅包括其他轉(zhuǎn)錄本匯編程序也可以使用短讀序列的對(duì)比。為了在實(shí)驗(yàn)之間鑒定差異表達(dá)的基來(lái)自:百科
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