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基因,可以使用Ballgown,Cuffdiff或其他(DESeq,edgeR等)專用軟件來處理StringTie的輸出。 配置流程 1.配置編譯環(huán)境 安裝相關依賴 yum install-y zlib zlib-devel 2.獲取源碼 獲取“stringtie-1.3.6”源碼包。來自:百科對簡單的任務(例如,將兩個間隔文件相交),但可以通過在UNIX命令行上組合多個bedtools操作來進行相當復雜的分析。 配置流程 1. 配置編譯環(huán)境 安裝相關依賴。 yum install zlib-devel bzip2-devel xz-devel -y 2. 獲取源碼 獲取“bedtools-2來自:百科
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的格式。 編譯和測試方式 1.配置編譯環(huán)境 1)安裝wget工具。 yum install wget -y 2)安裝或者升級cmake版本到3.1.0或更高版本。 cd /usr/local/src yum remove cmake cmake-data wget https://cmake來自:百科
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再次保存。 編譯和測試方式 1.選擇操作環(huán)境 本文選用華為鯤鵬云服務E CS KC1實例做測試 2.配置編譯工具 1)編譯TinyXML需要g++編譯器因此需要安裝g++。 yum install gcc-c++ -y 2)獲取源代碼。 3)執(zhí)行以下命令,獲取TinyXML軟件包。來自:百科
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