華為云計算 云知識 什么是Miniasm
什么是Miniasm

簡介

Miniasm是由李恒開發(fā),適合于小基因組及重復(fù)序列比例低的基因組組裝,相對于Canu和Falcon軟件,Miniasm組裝速度非???。建議通過git下載最新版本。

配置流程

1.配置編譯環(huán)境

1)安裝wget工具。

yum install wget-y

2)安裝miniasm依賴庫和工具

yum install-y git gcc-c++zlib*-y

----結(jié)束

2.獲取源碼

獲取“miniasm”源碼包。

cd/usr/local/src
git clone https://github.com/lh3/miniasm

3.編譯和安裝

編譯miniasm

cd/usr/local/src/miniasm
make

4.運行和驗證

查看miniasm的版本信息。

cd/usr/local/src/miniasm
./miniasm-V

回顯內(nèi)容如下,表示安裝成功。

0.3-r179