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該解決方案有何用途?

該解決方案基于開(kāi)源軟件SlurmGearbox構(gòu)建,快速幫助用戶在華為云云服務(wù)器上完成基因測(cè)序HPC環(huán)境的部署。Slurm是一個(gè)開(kāi)源、容錯(cuò)和高度可擴(kuò)展的集群管理和作業(yè)調(diào)度系統(tǒng),用于大型和小型Linux集群。該方案適用于基因行業(yè)的基因測(cè)序、數(shù)據(jù)管理和集群調(diào)度等場(chǎng)景。

方案部署架構(gòu)

該方案可以幫助您在華為云上快速搭建基于開(kāi)源集群管理和作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)Slurm的基因測(cè)序HPC環(huán)境。

快速構(gòu)建基因測(cè)序環(huán)境

版本:2.1.0

上次更新日期:2024年7月

來(lái)源:由華為云構(gòu)建

部署:預(yù)計(jì)45分鐘

卸載:預(yù)計(jì)10分鐘

數(shù)據(jù)中心:

架構(gòu)描述

架構(gòu)描述

  • 創(chuàng)建三臺(tái)華為云Flexus云服務(wù)器X實(shí)例,一臺(tái)調(diào)度節(jié)點(diǎn),兩臺(tái)計(jì)算節(jié)點(diǎn)。自動(dòng)部署HPC開(kāi)源調(diào)度軟件Slurm,提供基因測(cè)序HPC環(huán)境。

  • 創(chuàng)建一個(gè)彈性文件服務(wù) SFS Turbo,為基因測(cè)序HPC環(huán)境提供共享文件存儲(chǔ)服務(wù)。

  • 創(chuàng)建安全組,可以保護(hù)云服務(wù)器的網(wǎng)絡(luò)安全,通過(guò)配置安全組規(guī)則,限定云服務(wù)器的訪問(wèn)端口。

  • 創(chuàng)建一個(gè)彈性公網(wǎng)IP EIP并綁定在調(diào)度節(jié)點(diǎn)服務(wù)器上,用于用戶訪問(wèn)基因測(cè)序HPC環(huán)境。

  • 在調(diào)度節(jié)點(diǎn)安裝Gearbox程序、配置Java環(huán)境。

  • 使用云監(jiān)控服務(wù) CES,Gearbox程序監(jiān)測(cè)集群作業(yè)狀態(tài),計(jì)算自定義指標(biāo)Workload值,上報(bào)指標(biāo)到云監(jiān)控服務(wù)。

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