項目簡介
中國科學院腦科學與智能技術卓越創(chuàng)新中心(簡稱“中科院腦智卓越中心”)是將腦科學與智能技術相結合、了解大腦如何實現(xiàn)各種認知功能的機構,已在特定領域成功實現(xiàn)了國際領跑的目標。
腦聯(lián)接圖譜大數(shù)據(jù)是認識腦功能和腦模擬的重要基礎和必要數(shù)據(jù)。中科院腦智卓越中心首選的研究對象是腦容量相對較小的斑馬魚,它大約只有10萬個神經元和1億個突觸,神經系統(tǒng)相對保守,是目前真正可以實現(xiàn)在活的個體上進行全腦范圍神經元結構觀察和電活動觀察的模式脊椎動物。
在繪制全腦聯(lián)接圖譜的過程中,單個神經元的形態(tài)重構是一個耗時耗力的步驟。斑馬魚魚腦體積不到0.2mm3,如一粒沙塵,但卻有10萬個神經元、一億個連接,是個通用智能系統(tǒng)。按照全腦10萬個神經元來計算,總的成像數(shù)據(jù)可達130T,如果完全依靠人工進行3D形態(tài)重構,需要125個人干一年,或者1個人干125年。
業(yè)務挑戰(zhàn)
繪制全腦聯(lián)接圖譜的成像數(shù)據(jù)、工作量大
解決方案
華為云ModelArts 加速神經元投射路徑追蹤速度
中科院腦智卓越中心通過利用華為云ModelArts的超大集群和大規(guī)模分布式訓練,提升神經元投射路徑追蹤速度。
用360條斑馬魚圖像樣本所包含的近20萬圖像塊的“金標準”標注數(shù)據(jù),訓練出了從前期圖像分割到后期神經元形態(tài)追蹤的一整套網絡。
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